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靶細(xì)胞群的轉(zhuǎn)化可能性,這可能與細(xì)胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)?;谝延锌茖W(xué)經(jīng)驗和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險因素,評估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點分析,分析細(xì)胞的克隆組成以及在關(guān)注基因(如liu相關(guān)調(diào)控基因)附近有無優(yōu)先整合跡象,含有關(guān)注整合位點的細(xì)胞有無優(yōu)先異常增殖。如何確定慢病毒/逆轉(zhuǎn)錄病毒前病毒整合位點?溫州慢病毒載體整合位點報告
由于免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的長期存活及持久性作用,申請人應(yīng)對臨床試驗期間接受zhiliao的所有受試者進(jìn)行適當(dāng)?shù)拈L期隨訪,關(guān)注受試者生存、新發(fā)或繼發(fā)aizheng、ganran、免疫功能變化及遲發(fā)性不良反應(yīng)等安全性風(fēng)險,以及非臨床或臨床數(shù)據(jù)提示需要關(guān)注的潛在風(fēng)險,并觀察產(chǎn)品在體內(nèi)的持續(xù)存在時間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時間(如有)、是否有致瘤性、免疫原性等。隨訪時間主要取決于免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險水平、體內(nèi)的存活和作用時間、疾病進(jìn)程的認(rèn)識等,應(yīng)足以觀察到可能由于產(chǎn)品特性、暴露性質(zhì)等導(dǎo)致的受試者風(fēng)險,并不應(yīng)短于遲發(fā)不良事件的預(yù)期發(fā)生時間。上海整合位點政策整合位點技術(shù),推薦唯可生物,實驗實力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
全基因組測序是對重組細(xì)胞的基因組DNA進(jìn)行深度測序,技術(shù)成熟簡單這里不做介紹了,我們分享一下LM-PCR結(jié)合二代測序的檢測方法。LM-PCR全稱連接介導(dǎo)的PCR。將含有慢病毒插入的基因組進(jìn)行隨機(jī)打斷并連接接頭,然后通過兩輪PCR富集含有慢病毒LTR-宿主區(qū)域的嵌合序列。此擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行二代測序即可以分析確定載體在宿主基因組上的整合位點。LM-PCR與高通量測序技術(shù)相結(jié)合后,有了更為豐富的應(yīng)用場景。比如,識別整合載體(慢病毒載體,轉(zhuǎn)座子)的整合位點。該技術(shù)廣泛應(yīng)用于基因zhiliao研究基因修飾細(xì)胞的克隆組成,或者通過研究整合事件評估新載體系統(tǒng)的生物安全性。
病毒載體介導(dǎo)的外源基因隨機(jī)插入的可能風(fēng)險之一是其可能整合到宿主細(xì)胞的原基因或抑基因內(nèi)引發(fā)插入性誘變(insertionalmutagenesis),導(dǎo)致基因的jihuo或抑基因的抑制,從而誘導(dǎo)的發(fā)生。這些潛在的副作用已經(jīng)引起人們的極大關(guān)注,因此亟需發(fā)展普適的整合位點檢測手段來評估以病毒為載體的基因zhiliao的安全性。病毒載體整合位點檢測能夠特異性捕獲整合位點序列,經(jīng)過文庫構(gòu)建、二代測序及生物信息學(xué)分析,即可得出病毒載體在細(xì)胞中的整合位點。采用LM-PCR和全基因組重測序兩種方法,可以有效分析重組細(xì)胞外源序列的整合位點。
對確證性臨床試驗的療效和安全性要求:“繼續(xù)監(jiān)測安全性風(fēng)險,分析重要的已知和潛在的風(fēng)險信息,包括遲發(fā)性不良事件(如致瘤性)的發(fā)生率、 嚴(yán)重性和危險因素等,并有必要采取措施使風(fēng)險較小化。" 2021年2月發(fā)布的《基因修飾細(xì)胞zhiliao 產(chǎn)品非臨床研究與評價技術(shù)指導(dǎo)原則(試行)》則明確將"插入突變風(fēng)險評估"作為非臨床安全性研究的內(nèi)容,并詳細(xì)規(guī)定關(guān)鍵風(fēng)險因素的評估要點。可見慢病毒載體整合位點檢測已經(jīng)成為細(xì)胞zhiliao 產(chǎn)品IND評審及臨床試驗安全性評估的必檢內(nèi)容。整合位點一般有哪些測序方法?廣州慢病毒整合位點服務(wù)
對T細(xì)胞受體(TCR)β鏈庫進(jìn)行深度測序(TCR-seq)以及慢病毒載體整合位點(LVIS)分析。溫州慢病毒載體整合位點報告
例如,對于經(jīng)過基因修飾的免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品如CAR-T,采用實時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qPCR)和流式細(xì)胞術(shù)(Flowcytometry)進(jìn)行PK分析,分別通過測定外源基因拷貝和CAR+細(xì)胞數(shù)量的變化,有助于互相驗證檢測方法的可靠性,可以更duomian的分析產(chǎn)品在體內(nèi)的擴(kuò)增和存活情況。對于大多數(shù)免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品,可以通過細(xì)胞和/或體液免疫應(yīng)答分析藥效學(xué)活性。有多個特異性靶點的zhiliao產(chǎn)品,應(yīng)分析其對每個靶點的作用活性。如果細(xì)胞經(jīng)體外基因修飾,在體內(nèi)分泌特定蛋白、多肽或其它活性成分,或敲除了特定基因的表達(dá),也需要進(jìn)行針對性的藥效學(xué)分析,如檢測特定蛋白的活性、持續(xù)時間和變化情況等。溫州慢病毒載體整合位點報告