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體外蛋白表達(dá)正在推動(dòng) 無細(xì)胞合成生物學(xué) 的范式革新:人工代謝通路重構(gòu): 在裂解物中整合多酶級(jí)聯(lián)反應(yīng),利用底物通道效應(yīng)實(shí)現(xiàn)小分子化合物的高轉(zhuǎn)化率合成;基因振蕩器開發(fā): 通過T7 RNA聚合酶的自調(diào)控表達(dá)構(gòu)建分子鐘,模擬細(xì)胞周期節(jié)律;仿生細(xì)胞構(gòu)建: 將蛋白表達(dá)系統(tǒng)封裝于脂質(zhì)體內(nèi),結(jié)合ATP再生模塊(如bing tong酸激酶系統(tǒng))創(chuàng)建可自我維持的人工細(xì)胞雛形。這種 “設(shè)計(jì)-構(gòu)建-測(cè)試”閉環(huán) 明顯加速了生物系統(tǒng)的理性設(shè)計(jì)進(jìn)程。nuclera 高通量微流控蛋白表達(dá)篩選系統(tǒng)可助力體外蛋白表達(dá),如想了解更多信息,歡迎咨詢官方代理商上海曼博生物!兔網(wǎng)織紅細(xì)胞裂解物??含??成熟血紅蛋白合成機(jī)制??,能準(zhǔn)確折疊多結(jié)構(gòu)域蛋白。大規(guī)模蛋白表達(dá)流程
體外蛋白表達(dá)系統(tǒng)的本質(zhì)是利用 純化的細(xì)胞裂解物(含核糖體、tRNA、翻譯因子及能量再生組分)重構(gòu)蛋白質(zhì)合成機(jī)器。在ATP/GTP供能條件下,核糖體通過mRNA模板介導(dǎo)的密碼子-反密碼子配對(duì),驅(qū)動(dòng)氨基酸按序列聚合成肽鏈。該過程的關(guān)鍵調(diào)控點(diǎn)包括:翻譯起始效率(受5'UTR二級(jí)結(jié)構(gòu)及Shine-Dalgarno序列影響)、延伸速率(依賴EF-Tu/G因子濃度)和終止準(zhǔn)確性(釋放因子RF1/2活性)。體外蛋白表達(dá)的高效性源于其 去除了細(xì)胞膜屏障,使反應(yīng)底物濃度可人為提升至生理水平的10-100倍,大幅加速肽鏈合成動(dòng)力學(xué)。常用蛋白表達(dá)水平預(yù)混 1× 蛋白酶抑制劑可防止 ??新合成體外表達(dá)蛋白?? 被裂解物內(nèi)源酶降解。
無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)的模板可以是線性DNA(如PCR產(chǎn)物)或環(huán)狀質(zhì)粒,需包含啟動(dòng)子(如T7/T3/SP6)和核糖體結(jié)合位點(diǎn)(RBS)以啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄翻譯。為提升效率,系統(tǒng)可能添加分子伴侶(如DnaK/GroEL)輔助蛋白折疊,或氧化還原劑(如谷胱甘肽)促進(jìn)二硫鍵形成。部分高級(jí)系統(tǒng)(如PURE體系)使用純化重組元件替代粗提物,實(shí)現(xiàn)更高可控性,但成本較高。無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)可靈活引入非天然氨基酸(nnAA),擴(kuò)展了蛋白質(zhì)的功能多樣性。例如,通過定制tRNA和氨酰-tRNA合成酶,無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)系統(tǒng)能準(zhǔn)確將熒光標(biāo)記或交聯(lián)基團(tuán)嵌入目標(biāo)蛋白,用于結(jié)構(gòu)生物學(xué)或藥物偶聯(lián)開發(fā)。更前沿的應(yīng)用是人工生命體系的構(gòu)建,如利用無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)合成噬菌體或人工細(xì)胞雛形,結(jié)合微流控技術(shù)模擬細(xì)胞內(nèi)代謝網(wǎng)絡(luò),為合成生物學(xué)研究提供可控的簡(jiǎn)化模型。
無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)在藥物研發(fā)領(lǐng)域具有明顯優(yōu)勢(shì),尤其適用于快速生產(chǎn)zhi liao性蛋白、抗體和疫苗抗原。例如,在COVID-19期間,研究人員利用CFPS在幾小時(shí)內(nèi)合成COVID-19刺突蛋白的RBD結(jié)構(gòu)域,大幅加速了疫苗候選分子的篩選和驗(yàn)證。此外,該技術(shù)可高效表達(dá)傳統(tǒng)細(xì)胞系統(tǒng)難以生產(chǎn)的毒性蛋白(如某些抗ai藥物靶點(diǎn))或易降解蛋白(如細(xì)胞因子),并支持非天然氨基酸插入,為抗體藥物偶聯(lián)物(ADCs)的開發(fā)提供準(zhǔn)確修飾平臺(tái)。相比哺乳動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)(通常需要1-2周),CFPS可在24小時(shí)內(nèi)完成從基因到蛋白的全流程,明顯縮短藥物發(fā)現(xiàn)周期。從模板添加到獲得功能性體外表達(dá)蛋白只需6小時(shí)??,而HEK293系統(tǒng)需兩周。
體外蛋白表達(dá)系統(tǒng)的明顯缺陷在于 缺乏真核細(xì)胞器結(jié)構(gòu),導(dǎo)致關(guān)鍵翻譯后修飾難以實(shí)現(xiàn):糖基化不完整性: 裂解物中缺乏高爾基體轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制,只能生成高甘露糖型等簡(jiǎn)單糖鏈,無法合成復(fù)雜雙觸角N-糖;磷酸化/乙?;Ш猓?激酶/磷酸酶網(wǎng)絡(luò)不完整,使信號(hào)通路蛋白的修飾狀態(tài)與生理?xiàng)l件差異明顯;二硫鍵錯(cuò)配風(fēng)險(xiǎn): 氧化還原環(huán)境調(diào)控不足導(dǎo)致多二硫鍵蛋白錯(cuò)誤折疊率升高。這些局限使體外蛋白表達(dá)在 zhi liao性抗體等需精確修飾的蛋白生產(chǎn)中應(yīng)用受限。大腸桿菌裂解物的??高翻譯效率??可支持??100μg/mL級(jí)??蛋白產(chǎn)量,但缺乏糖基化修飾能力。大腸桿菌誘導(dǎo)蛋白表達(dá)優(yōu)化
隨著工程化裂解物與自動(dòng)化設(shè)備的進(jìn)步,體外蛋白表達(dá)技術(shù)將成為生命科學(xué)工具箱中的常備利器。大規(guī)模蛋白表達(dá)流程
從實(shí)驗(yàn)室走向產(chǎn)業(yè)化,無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)還面臨多重障礙。規(guī)?;a(chǎn)時(shí),反應(yīng)體系的均一性和重復(fù)性難以保證,且大規(guī)模制備高活性裂解物的成本效益比仍需優(yōu)化。在下游純化環(huán)節(jié),由于反應(yīng)混合物中含有大量核酸、酶和其他細(xì)胞組分,目標(biāo)蛋白的分離純化步驟比傳統(tǒng)方法更復(fù)雜。此外,目前大多數(shù)CFPS工藝仍處于分批反應(yīng)模式,連續(xù)化生產(chǎn)設(shè)備的開發(fā)滯后,限制了其在工業(yè)流水線中的應(yīng)用潛力。盡管存在這些挑戰(zhàn),隨著微流控技術(shù)、人工智能優(yōu)化反應(yīng)條件等新方法的引入,CFPS技術(shù)正在逐步突破這些產(chǎn)業(yè)化瓶頸。大規(guī)模蛋白表達(dá)流程